John Wheeler orientou mais teses de doutorado do que qualquer outro professor de física de Princeton. Entre elas,
Richard Feynman , um dos arquitetos da eletrodinâmica quântica (QED), e
Hugh Everett III , inventor da "função de onda universal" e da formulação de "estado relativo" da mecânica quântica, posteriormente conhecida como interpretação de "muitos mundos".
No final da década de 1930, Wheeler trabalhou com Niels Bohr para demonstrar que o U- 235 era o elemento físsil do urânio, abrindo caminho para a bomba atômica. (Wheeler tornou-se um grande defensor das armas atômicas e, posteriormente, das armas nucleares, incentivando seu uso contra a União Soviética para destruir o comunismo.)
Após a Segunda Guerra Mundial, Wheeler colaborou com Feynman para defender a existência de ondas eletromagnéticas esféricas incidentes (o chamado potencial "avançado"). Já em 1905, Albert Einstein argumentava contra a existência de ondas esféricas emitidas (o potencial "retardado" normal) e defendia que a luz era composta por um grande número de "quanta de luz" discretos (posteriormente chamados de fótons).
Wheeler contribuiu muito para as novas descobertas em astrofísica e cosmologia, sendo especialmente talentoso em nomeá-las, por exemplo, "Buraco Negro", "Buraco de Minhoca", "Feito de Bit" e "Escolha Retardada".
Em 1978, Wheeler publicou um longo artigo intitulado "
O 'Passado' e o Experimento da Dupla Fenda da 'Escolha Atrasada' ".
Nela, Wheeler escreveu
Pode-se escolher se o fóton (ou elétron) passará por ambas as fendas, ou apenas por uma delas, depois de já ter atravessado esta tela [p.9]